萊頓大學為歐洲學術聲譽最高的綜合性大學之一。秉承“自由之棱堡”的校訓，她是歐洲最早實踐宗教和信仰自由的大學之一。其開放包容的治校精神，從荷蘭黃金時代時代以來，吸引了無數頂尖國際學者慕名前往，在自由學術環境下潛心治學，讓其一度成為歐洲科學人文中心。“近代科學始祖”笛卡爾，在萊頓大學訪學期間完成發表《第一哲學沉思錄》；“歐洲最偉大藝術家之一”倫勃朗在萊頓年代，突破油畫藝術史上里程碑式的光線技術（light and variety of paint application）；愛因斯坦在萊頓大學長達近二十年的客座教授期間，留下了《玻色-愛因斯坦凝聚態》等研究手稿。

全球高校千年排名將萊頓大學位列全球名校第29位，名列17世紀荷蘭黃金時代(Dutch Golden Age)世界名校第4位。2013年《泰晤士高等教育世界大學排名》(Times Higher Education’s World University Rankings) 給出的排名中，萊頓大學的全球綜合排名位列第64位，為荷蘭排名最高的大學。此外，幾乎歷年《泰晤士高等教育世界大學排名》(Times Higher Education’s World University Rankings) 給出的人文科學專業(Arts and Humanities)排名中，萊頓大學均排名歐洲大陸第1位(Continental Europe Ranking No. 1)。根據2014年《QS世界大學排名》，萊頓多個學科領域排名世界頂尖。其中法學排名全球23位，語言學26位，歷史和考古學28位，政治學與國際關系學第34位，醫學第36位。在2015－2016年《泰晤士高等教育世界大學排名》中，人文學科排名位列世界第17位，再次名列歐洲大陸高校排行榜首。

萊頓大學是科英布拉集團的創立成員之一 (即Coimbra Group，簡稱CG，是由39所歐洲最古老且富盛望的精英大學組成的集團），同時也是Europaeum（歐洲10所知名大學聯合體）和League of European Research Universities （歐洲頂尖研究型大學聯盟）的創立成員。
萊頓是一座典型的大學城，大學各學院遍布全萊頓城，萊頓大學的莘莘學子也讓萊頓這座古典美麗的歐洲小城的氣氛更加輕松而充滿活力。日本著名的俳句作者蒲原宏曾詠嘆：“萊頓大學城，月色涼如冰”。詩中所提到的這個大學是荷蘭最古老的大學，這里也是著名畫家倫勃朗的出生地。

在歐洲，萊頓與牛津堪稱雙子，前者是歐洲大陸聲望及學術地位最高的大學所在地，后者是英格蘭最古老的大學——牛津大學所在地。每年牛津和萊頓都會有定期的官方交流活動。

院系設置

萊頓大學沒有中央校園；所有建筑散布在城市各處。有些建筑年代非常久遠，例如Gravensteen (現為萊頓的國際辦公室)；如Lipsius以及Gorlaeus。
萊頓大學共分為7大學院(截至2015年)[13]  ，50多個系所，150多個專業與超過100個以上的研究所：
考古學院（Faculty of Archaeology）；
海牙校區（Faculty Campus The Hague）；
人文學院（Humanities）；
法學院（Leiden Law School）；
萊頓醫學中心（Leiden University Medical Center）；
科學院（Faculty of Science）；
社會學與行為科學學院（Faculty of Social and Behavioural Sciences）；
其他學院：
萊頓大學學院—海牙（Leiden University College The Hague）；
教育學院（School of Education）；
創作及表演藝術學院是由萊頓大學、Royal Conservatory以及Royal Academy for Art合作創建的。該大學沒有經濟學、商學與管理學院。然而，2002年創立了萊頓管理學校(LUSM)，提供6個專業MBA課程。此課程只維持四年，也就是2006年所有管理課程都被取消。然而萊頓管理學校發展了其他商業管理活動，使得他們與大學內的學院關系更密切。他們與數學學院合作提供理學碩士學位：商業信息通信技術專業。